草莓果实中七次跨膜受体蛋白生物信息学及时空表达特征分析

• 作者: 丁宁 姜金铸 李兴亮 李冰冰 范意娟 贾文锁 贾美茹 魏灵芝
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 果实发育 7次跨膜受体蛋白 脂联素受体
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 转基因研究
• 页码范围: 73-81
• 分类号: S668.4|Q811.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2015.03.11

摘要

以草莓为试材,基于拟南芥(Arabidopsis thaliana)、人(Homo sapiens)和家鼠(Musmusculus)等数据库信息,采用同源比对方法,结合ClustalX 2.0序列比对及MEGA 5.0系统进化树分析,对草莓基因组中7TMR的基础生物信息进行了分析.结果表明,草莓基因组中含有84个7TMR,包括23个亚家族.半定量RT-PCR分析表明,该家族全部成员中有33个成员随果实发育表达量明显上调,17个成员表达量明显下调;Real-time PCR分析进一步确认,部分7TMR成员的基因表达与果实发育及成熟过程的整个进程有着密切的关系.此外还发现,草莓中7TMR家族中含有一类特殊的亚家族蛋白,该亚家族与人和家鼠中的脂联素受体高度同源,表明草莓中7TMR存在着非G-蛋白偶联信号转导途径.草莓中类似脂联素受体亚家族ADIPOR包含5个成员,对这5个成员的时空表达和刺激应答进行了分析,发现其中某些成员不仅与果实发育进程关系密切,且对糖信号应答,暗示着该类蛋白在草莓果实发育和成熟调控中可能起着重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兴亮	中国农业大学农学与生物技术学院	3	1	1.0	1.0
2	丁宁	中国农业大学农学与生物技术学院	11	129	5.0	11.0
3	范意娟	中国农业大学农学与生物技术学院	3	36	2.0	3.0
4	贾美茹	中国农业大学农学与生物技术学院	2	1	1.0	1.0
5	魏灵芝	中国农业大学农学与生物技术学院	4	37	2.0	4.0
6	姜金铸	中国农业大学农学与生物技术学院	4	37	2.0	4.0
7	李冰冰	中国农业大学农学与生物技术学院	6	58	3.0	6.0