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白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析
白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析
作者:
任丽
张园
李慧玉
杨洋
董京祥
黄海娇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
白桦
TCP基因家族
生物信息学
基因表达
摘要:
[目的]通过研究白桦TCP转录因子的序列特征及其在不同时期组织中的表达规律,为揭示BpTCPs在白桦生长发育中的作用提供证据.[方法]依据白桦45个转录组测序结果,共获得15条TCPs基因.利用生物信息学方法对TCPs基因进行了全面分析,采用实时荧光定量PCR技术分析基因在不同组织中的表达模式.[结果]生物信息学分析发现,15条BpTCPs均含有1个高度保守的bHLH结构域,系统进化分析发现15条白桦TCP分属于TCP蛋白的两大类;qRT-PCR分析结果显示,自5月到9月的生长阶段中,顶芽中BpTCPs的表达水平呈现不同程度升高的变化趋势;茎中BpTCP3在整个生长季上调表达;BpTCP4、BpTCP10及BpTCP7、BpTCP8分别在越冬后的雌花及雄花中上调表达.[结论]明确了BpTCPs基因的功能及揭示其参与调控植物生长的分子机制奠定基础.
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文献信息
篇名
白桦BpTCPs基因家族生物信息学及时空表达分析
来源期刊
南京林业大学学报(自然科学版)
学科
农学
关键词
白桦
TCP基因家族
生物信息学
基因表达
年,卷(期)
2018,(4)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
113-118
页数
6页
分类号
S792|Q781
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2006.201709001
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李慧玉
东北林业大学林学院
28
246
9.0
15.0
2
董京祥
东北林业大学林学院
15
184
6.0
13.0
3
任丽
东北林业大学林学院
7
27
3.0
5.0
4
杨洋
东北林业大学林学院
9
36
4.0
5.0
5
张园
东北林业大学林学院
3
4
1.0
2.0
6
黄海娇
东北林业大学林学院
8
27
4.0
5.0
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引文网络
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二级引证文献(3)
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
白桦
TCP基因家族
生物信息学
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京林业大学学报(自然科学版)
主办单位:
南京林业大学
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-2006
CN:
32-1161/S
开本:
大16开
出版地:
南京市龙蟠路159号南京林业大学
邮发代号:
28-16
创刊时间:
1958
语种:
chi
出版文献量(篇)
4299
总下载数(次)
8
总被引数(次)
67156
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