三疣梭子蟹钙调蛋白基因的克隆及在蜕皮中的功能分析

• 作者: 刘萍 吕建建 张龙涛 高保全
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 三疣梭子蟹 钙调蛋白 基因克隆 基因表达 去眼柄
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1150-1159
• 页数: 10页
• 分类号: S96
• 字数: 6566字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2015.14554

摘要

基于转录组数据库信息,采用RACE技术克隆获得三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)钙调蛋白基因(PTCaM).该基因cDNA全长1981 bp,包含450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,预测分子量16.8 kD,理论等电点为4.09.对序列进行生物信息学分析发现,PTCaM是一个高度保守的序列,具有EF家族典型的EF-hand钙离子结合域.同源性分析结果表明,PTCaM基因编码的氨基酸与果蝇和中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的CaM氨基酸序列覆盖率高达100％,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、克氏原螯虾(Procambarus clarkia)和仿刺参(Apostichopus japonicus)覆盖率高达99％.系统进化表明,PTCaM基因氨基酸序列与凡纳滨对虾、中华绒螯蟹和克氏原螯虾聚为一支.通过分析不同蜕皮时期各个组织中PTCaM的表达情况得知,该基因在蜕皮时期的各个组织中均出现差异性表达,并且差异显著,说明该基因参与蜕皮调控过程.