浙江新昌光唇鱼(Acrossocheilus)COⅡ和D-loop基因克隆及系统发育分析

• 作者: 吕益龙 张玉明 李明云 潘娜 苗亮 赵亮 郭晓飞 陈炯
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 光唇鱼 COⅡ基因 D-loop基因 序列分析 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 381-388
• 分类号: Q346
• 语种: 中文
• DOI: 10.11693/hyhz20140900235

摘要

采用扩增COⅡ、D-loop序列、进行序列比对和系统树分析并结合形态特征观察的方法,研究了浙江新昌光唇鱼(A crossocheilus)的系统分类和种类鉴定.形态特征结果表明,新昌光唇鱼具有光唇鱼属鱼类的基本特征;扩增得到COⅡ序列全长691bp,D-loop序列全长931-944bp, A+T含量两基因序列都高于G+C (A+T的含量分别为57.30％-57.80％和65.30％-65.90％),G的含量在四种碱基中最低;COⅡ序列有6个碱基位点存在转换,而D-loop则存在多个碱基的转换、颠换、缺失或插入位点.浙江新昌光唇鱼群体内COⅡ、D-loop基因的平均遗传距离分别为0.003、0.005;基于COⅡ和D-loop序列构建的NJ法系统树均显示新昌光唇鱼与温州光唇鱼(A.wenchowensis)形成一个紧密的簇,序列相似性分别为99.94％和99.36％,遗传距离分别为0.000、0.011,未达到种间分化水平(遗传距离大于0.05),表明新昌光唇鱼与温州光唇鱼为同一种,且根据形态特征可以断定为二个不同的地理群体,而D-loop序列因进化速度较快更适于光唇鱼属种内及近缘物种的种间亲缘关系的研究.研究结果既有助于新昌光唇鱼资源的开发利用,又可为研究光唇鱼类的分类提供参考资料.