波纹鳜线粒体基因克隆及系统发育信息分析

• 作者: 安苗 宾石玉 杨丹丹 罗华辉 谢永广 陈敦学
• 来源期刊: 广西师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 波纹鳜 线粒体基因组 碱基偏好性 适应性 系统进化
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 119-126
• 页数: 8页
• 分类号: S961|Q959.483
• 字数: 4113字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16088/j.issn.1001-6600.2019.04.015

摘要

为了探讨鳜类线粒体基因组结构特征及系统发育信息,以期为鳜类遗传学研究和分子标记提供参考依据,本文将波纹鳜Siniperca undulata线粒体随机切割成长度为1～3 kb的15个片段,采用PCR产物直接测序法获得波纹鳜线粒体全基因组,并提交至NCBI数据库,获得登录号KJ644783.结果分析发现:波纹鳜线粒体包含13个编码蛋白基因、22个tRNA、2个rRNA以及一个超变区(D-loop),基因排列顺序与其他硬骨鱼类似,不存在基因重排现象.整个基因组存在明显的AC偏好性,其中G碱基含量非常低,仅仅为16.23％.系统发育信息分析结果显示,CO1、ND5、CYTB、ND4基因具有较好的进化适应性,能够较好地反映鳜类的系统发育关系.进一步的进化分析显示,鳜类分成了鳜属和少鳞鳜属.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	安苗	贵州大学动物科学学院	93	620	15.0	18.0
2	杨丹丹	贵州大学动物科学学院	6	10	2.0	3.0
3	陈敦学	贵州大学动物科学学院	6	7	2.0	2.0
4	谢永广	贵州大学动物科学学院	3	1	1.0	1.0
5	罗华辉	贵州大学动物科学学院	1	0	0.0	0.0