烟蚜线粒体基因组全序列及系统发育分析

• 作者: 喻会平 戴仁怀 杨洪 杨茂发 汪佳佳
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 蚜虫 烟蚜 线粒体基因组 RNA 二级结构 系统发育
• 年，卷（期）: 2017,（1）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 84-94
• 分类号: Q969
• 语种: 中文

摘要

[目的]蚜虫是杂食性农业害虫.本研究旨在通过线粒体基因组分析更好地了解蚜科昆虫的系统发育关系.[方法]结合第二代测序和PCR扩增技术获得了烟蚜Myzus persicae线粒体基因组全序列,与蚜科其他昆虫进行了对比分析;以贝叶斯法和最大似然法基于13个蛋白编码基因对蚜科进行了系统发育分析.[结果]烟蚜线粒体基因组(GenBank登录号:KU_236024)序列全长17 832 bp,A+T含量84.1％,AT偏斜为0.094,GC偏斜为-0.296.包含13个蛋白编码基因(cox1-3,nad1-6,nad4L,atp6,atp8和cytb),22个tRNA,2个rRNA基因(rrnL和rrnS)和2个长的非编码区,其基因排列顺序与已知的蚜科昆虫相似,除了nad4以单独的T结尾,所有的蛋白编码基因均以ATN作为起始密码子,TAA作为终止密码子.在烟蚜线粒体基因组中,tRNAGlu和tRNAPhe中间有一段307 bp的非编码区,该编码区包含2个重复单元,烟蚜的控制区长2 531 bp,是所有测序蚜虫线粒体基因组中最长的.rrnL的二级结构包含6个结构域,44个茎环结构;rrnS的二级结构有3个结构域,24个茎环结构.基于烟粉虱和其他20种昆虫的13个蛋白编码基因重建的BI和ML系统发育树,与传统形态学分类结果一致.[结论]蚜亚科和长管蚜亚科的单系性得到了很好的支持;在长管蚜亚科的分支中,M.persicae与D.noxia聚成一支,并且C.salicicola位于进化枝的底部.本研究结果为蚜科系统发生关系重建积累了有价值的数据资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨洪	贵州大学烟草学院	71	422	11.0	16.0
5	戴仁怀	贵州大学昆虫研究所	46	98	6.0	7.0
6	杨茂发	贵州大学烟草学院	168	894	13.0	19.0
10	喻会平		25	91	6.0	7.0
11	汪佳佳	贵州大学昆虫研究所	1	2	1.0	1.0