外显子捕获-高通量测序技术用于法洛四联症胎儿遗传学检测

• 作者: 刘翠云 孙瑞红 张菁菁 成建 梁栋 王艳 罗春玉 胡平 马定远
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 高通量测序技术 外显子捕获 法洛四联症 基因突变 CHD7 NOTCH2 CITED2
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 临床检验技术研究
• 页码范围: 405-408
• 页数: 4页
• 分类号: R725.4
• 字数: 3232字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2015.06.02

摘要

目的 用外显子捕获-高通量测序(exon-capture high-throughput sequencing,EC-HTS)技术寻找法洛四联症(tetralogy of fallot,TOF)胎儿可能存在的遗传学致病性证据,并探讨其在产前分子遗传学诊断中的价值.方法 选择经超声心动图发现且G显带和微阵列比较基因组杂交(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)分析结果均正常的9例TOF胎儿作为研究对象,以63个人类已知的先天性心脏病致病基因作为检测靶点制作捕获芯片,用EC-HTS技术进行检测,数据经过Calling、数据库比对、软件分析得到最终病理性突变位点;并用Sanger测序对其进行验证.结果 在9例胎儿中共检测到单核苷酸多态性(SNP)位点732个,结果经过生物信息学分析得到致病性突变位点3个:CITED2c.574_579 del AGCGGC(p.S192_G193de1纯合突变,CHD7c.2550_2554 del GAGAA(p.K850Nfs*6)杂合突变,NOTCH2 c.4918T＞C(p.F1640L)杂合突变.Sanger测序结果验证了这3个突变位点的真实存在,父母溯源检测发现这3个点突变均为新发突变.结论 用靶向性EC-HTS技术发现了3例TOF胎儿存在病理性基因突变,可能为其致病的遗传学病因.