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外显子捕获测序技术用于室间隔缺损胎儿遗传学病因检测
外显子捕获测序技术用于室间隔缺损胎儿遗传学病因检测
作者:
刘翠云
孙瑞红
张菁菁
成建
曹荔
梁栋
王艳
罗春玉
胡平
许争峰
马定远
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
室间隔缺损
外显子捕获
高通量测序
基因突变
遗传检测
JAG1
NOTCH2
CHD7
摘要:
目的::探讨外显子捕获-高通量测序技术检测室间隔缺损( VSD)胎儿遗传学病因的可行性。方法:选择超声心动图诊断为VSD且微阵列比较基因组杂交( aCGH )和G显带检测结果均正常的19例胎儿作为研究对象;将已知的63个人类先心病致病基因作为检测靶点制作成捕获芯片,对各个样本DNA进行外显子捕获后高通量测序,数据经过滤、数据库比对、生物学软件分析得到最终病理性突变位点;病理性突变位点用Sanger测序验证。结果:19例VSD胎儿中共检测到1540个基因突变位点,数据库比对、生物信息学分析后得到8个病理性突变位点:JAG1 c.1078T>G(p. C360G),CHD7 c.6718G>T (p. D2240Y),NOTCH2c.6131G>A(p. R2044H),MYH7 c.77C>T(p. A26V),ZFPM2 c.2107A>C(p. M703L),CHD7 c.7198C>T(p. R2400W),HAND2 c.341G>A(p. S114N), MLL2 c.1214012168delGGCCGTTAGCAATAGGAACTACCCCTGAG(p. G4047Vfs*5),其中MYH7、ZFPM2两个突变点为已报道突变,其余6例未见报道。8个突变位点的Sanger测序结果与高通量测序结果一致。父母溯源分析均为新发突变。结论:外显子捕获芯片用于VSD胎儿遗传学检测可提高阳性检出率,具有较好的临床应用价值。
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外显子组测序技术述评
外显子组测序
序列捕获
高通量测序
遗传诊断
内容分析
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文献信息
篇名
外显子捕获测序技术用于室间隔缺损胎儿遗传学病因检测
来源期刊
现代妇产科进展
学科
医学
关键词
室间隔缺损
外显子捕获
高通量测序
基因突变
遗传检测
JAG1
NOTCH2
CHD7
年,卷(期)
2015,(12)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
929-933
页数
5页
分类号
R541.1
字数
语种
中文
DOI
10.13283/j.cnki.xdfckjz.2015.12.013
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
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引文网络
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高通量测序
基因突变
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研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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现代妇产科进展
主办单位:
山东大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-7379
CN:
37-1211/R
开本:
大16开
出版地:
山东省济南市文化西路107号山东大学齐鲁医院内
邮发代号:
24-104
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
6119
总下载数(次)
11
总被引数(次)
40558
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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