牦牛AQP9基因CDS全长序列克隆及其生物信息学特征分析

• 作者: 丁艳平 伍志伟 刘健锋 王建林 邵宝平
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 AQP9基因 CDS区 分子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 1134-1140
• 页数: 7页
• 分类号: S823.8+5.2
• 字数: 3953字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.07.008

摘要

为了研究高原动物对青藏高原极端生境的适应机理,并为探讨高原动物适应机制提供基本数据.本研究运用基因克隆技术对牦牛脑AQP9基因CDS全长序列进行克隆,采用生物信息学方法进行分析,AQP9基因和编码序列特征进行了以下几方面的预测和分析:其物化性质、疏水性、跨膜结构和蛋白二级结构.结果表明,牦牛AQP9的CDS含有一个885 bp的开放阅读框,编码295个氨基酸;牦牛AQP9基因编码蛋白分子量和理论等电点分别为31.89 ku和6.21,其编码蛋白含有6次跨膜结构,属于疏水性蛋白;二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠及无规则卷曲构成;牦牛AQP9基因编码氨基酸序列与黄牛、藏羚羊、绵羊等物种间同源性较高,系统进化情况与其亲缘关系远近一致.本研究将为牦牛低氧适应性研究提供一定的基础资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王建林	兰州大学生命科学学院动物学与发育生物学研究所	51	245	9.0	13.0
2	邵宝平	兰州大学生命科学学院动物学与发育生物学研究所	28	89	5.0	8.0
3	丁艳平	西北师范大学生命科学学院	21	59	4.0	7.0
4	伍志伟	甘肃中医学院系统生物学与中医药转化研究所	23	23	3.0	4.0
5	刘健锋	兰州大学生命科学学院动物学与发育生物学研究所	7	40	2.0	6.0