牦牛PRDM9基因的CDS序列及其生物信息学分析

• 作者: 李铎 钟金城
• 来源期刊: 中国草食动物
• 学科: 农学
• 关键词: 牦牛 PRDM9基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 15-18
• 分类号: S823.2
• 字数: 2915字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-3887.2011.02.004

摘要

文章通过RT-PCR技术克隆了牦牛PRDM9基因的cDNA序列,利用DNAMAN、MAGA4、ExPASy等多个生物信息学软件进行了分析研究.结果表明:扩增出的牦牛PRDM9基因的编码区长1 533 bp,编码510个氨基酸.与普通牛、人和鼠相应基因核苷酸序列进行比对,其一致性分别为99%、76%和69%.预测的牦牛PRDM9蛋白二级和三级结构显示它是一个具有3种功能结构域的弱碱性螺旋状蛋白.这为今后的进一步研究提供了理论基础.