牦牛A-FABP基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 吴晓云 李天科 秦文 裴杰 阎萍
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牦牛 A-FABP基因 克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 86-91
• 语种: 中文

摘要

以牦牛的脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)基因为研究对象,根据GenBank收录的牛的A-FABP基因的mRNA序列设计一对特异性引物,以牦牛背最长肌为材料,采用RT-PCR方法克隆牦牛A-FABP基因的CDS区,并对其进行生物信息学分析.结果表明,牦牛A-FABP基因的CDS区全长399 bp,编码132个氨基酸;其编码的蛋白属于亲水性蛋白.二级结构主要由a-螺旋、β-折叠、延伸链以及无规卷曲组成,含有11个磷酸化位点.牦牛A-FABP基因编码的氨基酸序列与黄牛和水牛的同源性最高且都为97％,与其他物种的同源性也较高,说明在进化关系上A-FABP氨基酸序列较保守,此蛋白序列具Cytosolic fatty-acid binding家族蛋白功能结构域,无信号肽.