水稻干尖线虫氨基肽酶基因克隆及功能初步分析

• 作者: 李丹蕾 王博文 王峰 王步勇 陈俏丽 马玲
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻干尖线虫 氨基肽酶基因 基因克隆 生物信息学分析 原位杂交
• 年，卷（期）: 2015,（4）
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 分类号: S435.111.48|Q786
• 字数: 5449字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2015.04.001

摘要

为防治水稻干尖线虫病提供理论支持，研究了水稻干尖线虫氨基肽酶基因特征，并对其编码蛋白结构与功能进行分析。基于水稻干尖线虫转录组测序，并通过 RACE 技术，从水稻干尖线虫中克隆得到了一氨基肽酶基因 Ab-Ampep。生物信息学进行基因分析，原位杂交实验进行表达定位分析。该基因 CDS 序列全长为2787 bp，含有2个开放阅读框（ORF）。最长开放阅读框（ORF）大小2661 bp，可编码886个氨基酸，蛋白分子量为101．74 kDa，理论等电点（PI）为5．78。编码蛋白氨基酸序列中具有2个 Zn2＋结合位点和1个 PepN 保守结构域，有特征信号序列TISHELAHFW，属于谷氨酸锌蛋白（GluZincin）超家族。Ab-Ampep 氨基酸序列同挑选的其他9种动物的氨基肽酶氨基酸序列进行多重序列分析，发现功能区域的氨基酸序列较为保守，Ab-Ampep 与猪蛔虫（Ascaris suum）的氨基肽酶P（ERG83308．1）蛋白相似度最高为50％。系统进化树分析表明，Ab-Ampep 与猪蛔虫（A．suum ）的氨基肽酶P（ERG83308．1）蛋白在同一分支上，亲缘关系最近。蛋白质结构分析显示，α-螺旋为 Ab-Ampep 主要结构元件，能够形成金属离子 Zn2＋结合位点。原位杂交实验显示，经反义链探针处理的线虫在其生殖部位有颜色加深的杂交信号，该基因的表达位置主要在水稻干尖线虫的生殖部位。通过对水稻干尖线虫氨基肽酶基因研究，利用分子技术改造氨基肽酶或寻找氨基肽酶抑制剂，抑制氨基肽酶的表达，影响线虫生长发育，为防治水稻干尖线虫病提供新思路。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马玲	东北林业大学林学院	102	944	13.0	27.0
2	王博文	东北林业大学林学院	27	293	8.0	16.0
3	王步勇	东北林业大学林学院	14	82	4.0	9.0
4	李丹蕾	东北林业大学林学院	31	106	6.0	8.0
5	王峰	东北林业大学林学院	47	250	9.0	12.0
6	陈俏丽	东北林业大学林学院	26	83	6.0	7.0