水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析

• 作者: 李丹蕾 王博文 王峰 王步勇 陈俏丽 马玲
• 来源期刊: 湖南农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 水稻干尖线虫 SPRYSEC基因 原位杂交 cDNA末端快速扩增技术(RACE法)
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 305-311
• 页数: 7页
• 分类号: S435.111.4+8
• 字数: 4930字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13331/j.cnki.jhau.2016.03.016

摘要

根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用cDNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab-SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820).该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF).预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白.保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302 SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族.多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43％.蛋白结构分析结果表明,β-折叠与无规则卷曲是Ab-SPRYSEC蛋白的主要结构元件.表达定位分析结果表明,Ab-SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近.Ab-SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马玲	东北林业大学林学院	102	944	13.0	27.0
2	王博文	东北林业大学林学院	27	293	8.0	16.0
3	王步勇	东北林业大学林学院	14	82	4.0	9.0
4	李丹蕾	东北林业大学林学院	31	106	6.0	8.0
5	王峰	东北林业大学林学院	47	250	9.0	12.0
6	陈俏丽	东北林业大学林学院	26	83	6.0	7.0