杭州西溪湿地沉积物细菌的群落结构和多样性

• 作者: 方序 褚文珂 陈敏 黄媛
• 来源期刊: 海洋与湖沼
• 学科: 生物学
• 关键词: 西溪湿地 沉积物 细菌多样性 Illumina MiSeq高通量测序
• 年，卷（期）: 2015,（5）
• 页码范围: 1202-1209
• 分类号: Q938
• 语种: 中文
• DOI: 10.11693/hyhz20150700192

摘要

采用Illumina MiSeq高通量测序技术,对杭州西溪湿地4种不同植被下沉积物的细菌多样性进行了研究.通过提取样品基因组DNA,对16S rRNA V3、V4区测序,共获得有效序列67734条,产生2181个OTU,序列平均长度为441 bp,其中大于400bp的序列占99.74％.对97％相似水平的OTU代表序列进行分类学分析,结果表明,沉积物具有很高的细菌多样性,涵盖了30个门252个属的细菌.其中变形菌门(Proteobacteria)是各样品的优势类群,所占比例高达30.0％-64.7％.同时,β-变形菌纲、γ-变形菌纲和δ-变形菌纲在变形菌门中占主导地位,在这些类群中发现有大量与N、S等元素代谢相关的菌群,应该在湿地沉积物的元素循环中发挥着重要作用.此外,4个样品中约有10％-15％的序列属于无法确定分类位置(Unclassified)的类群,说明西溪湿地沉积物中蕴藏有较多的潜在新物种.本研究结果将为西溪湿地的保护和修复提供理论和实践依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈敏	杭州师范大学生命与环境科学学院	55	411	10.0	17.0
2	方序		12	75	6.0	8.0
3	褚文珂	杭州师范大学生命与环境科学学院	7	38	3.0	6.0
4	黄媛	杭州师范大学生命与环境科学学院	4	16	2.0	4.0