一株柯萨奇病毒B2分离株的VP1基因序列特征分析

• 作者: 朱艳菊 杨舜乔 潘明 苏婷 邵聪文 闫姗姗 陈伟 陈俊英 马绍辉
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒B2 VP1基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 49-53
• 分类号: R373.2+3|Q78
• 语种: 中文

摘要

目的 分析一株柯萨奇病毒(Coxsackievirus,CV)B2分离株(CVB2)全VP1基因序列特征.方法 用RD细胞对10份HFMD疑似患儿的粪便标本进行病毒分离,利用RT-PCR法从分离的病毒中扩增VP1基因,并测序,采用NCBI BLAST、Mega 6.1和Geneious等软件进行序列分析,并构建系统进化树.结果 从10份HFMD疑似患儿粪便中分离到一株CVB2,命名为509/YN/CHN/2010,其全长VP1基因的核苷酸长度与其他CVB2一致,均为846 bp.与中国其他分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.0％ ～ 95.3％和97.9％～98.9％,而与国外分离株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为81.1％ ～ 87.8％和97.9％ ～ 98.6％.在进化树上与其他中国分离株分属不同的两个分支,而与M10MG17亲缘关系较近.结论 509/YN/CHN/2010分离株为肠道病毒CVB2,为两个中国分支中的一支.