淋球菌por,tbpB基因序列变异和系统进化探讨

• 作者: 张绍基 杨昌伟 闵迅 颜利江 黄健 黄美容
• 来源期刊: 中国皮肤性病学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 淋球菌 por基因 tbpB基因 系统进化
• 年，卷（期）: 2015,（12）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1221-1223,1247
• 页数: 4页
• 分类号: R378.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13735/j.cjdv.1001-7089.201506095

摘要

目的 分析遵义地区淋球菌por,tbpB基因序列变异及系统进化关系.方法 对淋球菌por,tbpB基因进行测序鉴定,利用NG-MAST分型法对por,tbpB基因进行比对编号.用MEGA5.22软件中的邻接法构建系统发育树,并以Kimura 2-parameter模型计算序列间的遗传距离;Felsenstein法计算同义替换率(dS)和非同义替换率(dN).以RDP3软件对por,tbpB基因中的基因重组事件进行分析.结果 65株淋球菌共鉴定出19种por基因型和22种tbpB基因型.19种por基因型被划分为2个进化簇群,基因间平均遗传距离0.09.22种tbB基因型被划分为3个进化簇群,基因间平均遗传距离0.13.por,tbpB基因的dN＜dS.在tbpB基因中检测出8个基因重组事件,而por基因仅有1个.结论 本地区淋球菌por基因与tbpB基因的进化速度与方式存在一定差异,其中tbpB基因主要以基因重组的方式参与进化,por基因则可能以突变或缺失的方式参与进化.纯选择作用是维持本地区por,tbpB基因多态性的重要机制.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	闵迅	遵义医学院附属医院	39	93	5.0	8.0
2	张绍基	遵义医学院附属医院	20	49	4.0	5.0
3	杨昌伟	遵义医学院附属医院	25	60	5.0	6.0
4	黄健	遵义医学院附属医院	21	35	4.0	5.0
5	黄美容	遵义医学院附属医院	16	57	4.0	7.0
6	颜利江	遵义医学院附属医院	9	46	3.0	6.0