狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析

• 作者: 刘谢荣 刘铮铸 唐家明 巩元芳 张磊 徐桂利 李英杰 段玲欣 郭秀玲
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 狐狸 Agouti基因 SNPs 单倍型 毛色
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1692-1696
• 页数: 5页
• 分类号: S813.3
• 字数: 3295字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.09.028

摘要

旨在探究狐狸刺豚鼠基因(Agouti)多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系.本研究采用PCR和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的Ago“ti基因部分序列进行了SNPs筛查和单倍型分析.结果表明,在已测序的58只狐狸中首次发现6个SNPs(g.269G＞T、g.295C＞T、g.325T＞G、g.518G＞A、g.608C＞A和g.846G＞A),它们全部存在于内含子2上.狐属的所有个体(25只)在6个位点全部为纯合子基因型,依次为GG、CC、TT、GG、CC和GG型,而北极狐属的所有个体(33只)在这6个位点则均为另一种纯合子基因型,依次为TT、TT、GG、AA、AA和AA型.6个SNPs形成两种单倍型:单倍型Ⅰ(H1:GCTGCG)和单倍型Ⅱ(H2:TTGAAA),分布频率分别为42.1％和57.9％.单倍型Ⅰ(H1)分布于狐属3个狐种的所有受试个体中,单倍型Ⅱ(H2)分布于北极狐属两个狐种的所有受试个体中.进一步分析没有发现6个SNPs及其单倍型与狐狸毛色的明显关联性,但推测它们是区分狐属和北极狐属的重要功能位点和重要单倍型.