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摘要:
组分矢量构树(CVTree)方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据的海量增加;它自动对比物种亲缘关系与分类系统,并在网页上以交互作用形式显示,从而使研究更加直观。使用CVTree3网络服务器,用户可以快速的对未知的全基因组序列进行亲缘关系分析,并对其分类地位进行初步鉴定。由于合理利用全基因组信息,CVTree方法能对种以下的亲缘关系与分类具有高分辨力。随着CVTree方法的深入与完善,希望其能成为阐明原核生物亲缘关系与分类系统的定义性的工具。
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文献信息
篇名 基于全基因组的微生物亲缘关系与分类系统研究工具--CVTree3
来源期刊 生物技术通报 学科
关键词 CVTree 原核生物 全基因组 亲缘关系树 分类系统
年,卷(期) 2015,(11) 所属期刊栏目 特约综述--生物信息学专题
研究方向 页码范围 60-67
页数 8页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.11.009
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 郝柏林 复旦大学物理系和理论生命科学研究中心 21 96 6.0 9.0
2 左光宏 复旦大学物理系和理论生命科学研究中心 3 2 1.0 1.0
传播情况
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1985
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