基于血凝素裂解位点的DNA条形码在A型流感病毒分型中的应用

• 作者: 孙涛 孟慧芝 岳志芹 王文斌
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: A型流感病毒 血凝素(HA) DNA条形码 亚型鉴定
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 技 术 支 撑
• 页码范围: 55-61
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3157字
• 语种: 中文

摘要

为了建立一种快速鉴别AIV的HA亚型的RT-PCR方法，本研究探讨了流感病毒血凝素裂解位点基因作为DNA条形码对A型流感病毒进行亚型鉴定的可行性。通过生物信息学方法对16种A型流感病毒的血凝素基因全长进行比对，在HA裂解位点的两端高度保守区设计一对DNA条形码引物，RT-PCR扩增获得约170bp的核苷酸片段。利用MEGA5.0软件构建N-J系统树并计算亚型间及亚型内平均遗传距离。结果显示，不同A型流感病毒裂解位点氨基酸具有单系性，每一亚型可分别形成各自独立的分支。不同亚型间平均遗传距离为0.277，相同亚型内平均遗传距离0.032。研究表明，利用DNA条形码技术可在A型流感病毒分型方面进行有效的分子分类鉴定。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	岳志芹		54	250	9.0	13.0
2	孙涛		42	116	7.0	8.0