燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系

• 作者: 于华荣 刘景辉 张玉芹 徐寿军 高彩婷
• 来源期刊: 西北植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 燕麦 盐胁迫 Illumina测序 表达谱 生理响应
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1385-1393
• 页数: 9页
• 分类号: Q945.78|Q789
• 字数: 6569字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1000-4025.2015.07.1385

摘要

以耐盐燕麦品种VAO-9为材料,通过Illumina测序与数字基因表达谱技术对300 mmol/L NaCl处理前后的叶片cDNA文库进行RNA-Seq与DGE分析,同时测定0(CK)、100、200、250、300 mmol/L NaCl胁迫下VAO-9幼苗叶片的相对电导率、丙二醛含量和脯氨酸含量,探讨燕麦盐胁迫响应基因的差异表达与生理响应的关系.结果表明:(1) RNA-Seq分析得到Unigenes 65 801条,其基因表达呈现高度的不均一性和冗余性;若差异基因表达谱鉴定分析以log2 Ratio≥2且FDR值≤0.001为选择标准,则发现上调和下调表达基因在胁迫0.5h时分别有306和64个,在胁迫3h时分别有639和290个,胁迫24 h时分别有1 488和882个.(2) KEGG代谢分析显示,有23 652条Unigenes比对到KEGG中的128条代谢途径,包括与逆境胁迫相关的植物激素信号转导途径、ABC转运蛋白途径、肌醇磷酸代谢途径、渗透调节途径等.(3)在300 mmol/L NaCl处理下燕麦叶片的相对电导率、丙二醛含量、脯氨酸含量等生理指标的变化与相关差异表达基因的变化趋势基本一致,说明基因差异表达量与生理反应密切相关.研究认为,在相同的栽培及胁迫处理条件下,可根据植物盐响应生理指标的变化判断耐盐基因的表达情况.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘景辉	内蒙古农业大学农学院	230	3294	28.0	45.0
2	张玉芹	内蒙古民族大学农学院	56	611	12.0	23.0
3	徐寿军	内蒙古民族大学农学院	71	646	13.0	23.0
4	高彩婷	内蒙古农业大学农学院	9	96	5.0	9.0
6	于华荣	内蒙古民族大学农学院	17	59	4.0	6.0