猪博卡病毒的基因分型

• 作者: 佟铁铸 刘星 周宇 唐连飞 朱中武 朱事康 林志雄 禹思宇 罗卓军 陈燕忠
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 猪博卡病毒 遗传进化分析 基因分型
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 页码范围: 63-68
• 页数: 6页
• 分类号: S852.651
• 字数: 2794字
• 语种: 中文

摘要

为了解猪博卡病毒（PBoV）的遗传进化规律，研究可行的PBoV基因分型方法，本研究利用GenBank中登录的29条PBoV和2条本实验室测得的全基因组序列信息，采用生物信息学软件进行基因组序列分析。结果显示，分别以NS1基因、NP1基因和VP1基因编码氨基酸构建的系统进化树，PBoV均被划分为3个基因群，但三种氨基酸序列绘制的进化树存在差异；基因群内各病毒株的氨基酸序列同源性较高，而各基因群之间病毒株的氨基酸序列同源性非常低，基因组结构差异较大。