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犬副流感病毒分子克隆的构建及全基因组序列分析
犬副流感病毒分子克隆的构建及全基因组序列分析
作者:
刘明
宋彩玲
曲连东
陈小微
齐宾宾
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
犬副流感病毒
分子克隆
基因组测序
系统进化分析
摘要:
为了解犬副流感病毒(CPIV)的基因组结构与遗传进化特征,应用 RT-PCR 分段扩增 HRB-V毒株的5个片段,f1、f2、f3以及5′-末端和3′-末端,克隆到 pHW2000载体中并进行测序。经序列拼接获得全基因组序列,与 GenBank 登录的副流感病毒代表毒株进行对比分析。基因序列分析表明,HRB-V 株基因组全长15246 nt,含5′-末端、3′-末端和7个 ORF 具有副流感病毒基因组结构的典型特征;将结构蛋白 F、HN 以及全基因序列与参考毒株进行比较分析并做遗传进化树,结果表明,HRB-V 与 CPI-和 CPI+属同一分支,亲缘性相近。核苷酸以及氨基酸序列同源性分析结果表明,HRB-V 与各病毒株的 F 基因的核苷酸同源性在96.5%~98.8%之间,氨基酸同源性为94.2%~98%;HN 基因的核苷酸同源性在98.1%~99.5%之间,氨基酸同源性为97%~99.3%。以上试验证明副流感病毒人、猴、猪和犬 SV5分离株基因差异较小,具有高度同源性。研究副流感病毒分子克隆的结构,为研究犬副流感病毒反向遗传操作技术平台奠定基础。
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文献信息
篇名
犬副流感病毒分子克隆的构建及全基因组序列分析
来源期刊
动物医学进展
学科
农学
关键词
犬副流感病毒
分子克隆
基因组测序
系统进化分析
年,卷(期)
2015,(10)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
10-14,15
页数
6页
分类号
S852.659.5
字数
3863字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
刘明
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
73
734
12.0
25.0
2
曲连东
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
40
213
8.0
13.0
3
宋彩玲
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
2
3
1.0
1.0
4
齐宾宾
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
2
6
2.0
2.0
5
陈小微
中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室
1
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研究主题发展历程
节点文献
犬副流感病毒
分子克隆
基因组测序
系统进化分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
动物医学进展
主办单位:
西北农林科技大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1007-5038
CN:
61-1306/S
开本:
大16开
出版地:
陕西杨陵西北农林科技大学动物医学院
邮发代号:
52-60
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
7631
总下载数(次)
22
总被引数(次)
56446
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