八氢番茄红素合成酶(PSY)的生物信息学分析

• 作者: 李萍 熊建锐 王旭磊 麦秀英
• 来源期刊: 现代生物医学进展
• 学科: 生物学
• 关键词: 八氢番茄红素合成酶 生物信息学分析 番茄红素
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 1217-1221,1289
• 分类号: Q74
• 语种: 中文
• DOI: 10.13241/j.cnki.pmb.2015.07.005

摘要

目的:通过生物信息学方法对八氢番茄红素合成酶基因(PSY)及氨基酸序列分析,并构建三维结构.方法:运用生物信息学方法对八氢番茄红素合成酶基因及其蛋白质序列的理化性质、亲/疏水性、信号肽、跨膜结构域、糖基化位点,磷酸化位点,二级结构,功能结构域和三级结构进行预测分析.结果:PSY基因含1239bp的开放阅读框,编码氨基酸数为412,为碱性不稳定蛋白;八氢番茄红素合成酶富含Arg、Leu、Ala、Ser、Val等氨基酸,为亲水性蛋白质;PSY为非跨膜蛋白,不合信号肽,具有多个磷酸化位点,α螺旋和无规卷曲是其主要结构元件.结论:用同源建模的方法构建其三维结构,得到合理模型,为采用生物工程提高番茄红素产量提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李萍	西南交通大学生命科学与工程学院	44	282	7.0	15.0
2	麦秀英	西南交通大学生命科学与工程学院	7	17	3.0	3.0
3	熊建锐	西南交通大学生命科学与工程学院	1	2	1.0	1.0
4	王旭磊	西南交通大学生命科学与工程学院	1	2	1.0	1.0