普通小球藻八氢番茄红素合成酶基因psy的cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘冬雨 陶贤继 魏华
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 八氢番茄红素合成酶 psy基因 普通小球藻 类胡萝卜素
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 171-182
• 页数: 12页
• 分类号: S917
• 字数: 6976字
• 语种: 中文
• DOI: 10.12024/jsou.20160401744

摘要

通过RACE-PCR首次克隆获得了普通小球藻(Chlorella vulgaris)中八氢番茄红素合成酶编码基因psy 的cDNA全长序列.该序列全长1 605 bp,包括1 245 bp开放阅读框,编码415个氨基酸.氨基酸序列对比及系统发生分析表明其与其他物种的PSY蛋白具有同源性,与绿藻聚为一支,与小球藻(Chlorella variabilis)、原壳小球藻(Auxenochlorella protothecoides)和佐夫色绿藻(Chromnochloris zofingiensis的遗传距离最近(分别为0.173、0.188和0.239),并具有较高的相似性(81％ ～ 84％)和一致性(69％ ～ 76％).亚细胞定位预测表明普通小球藻PSY前45个氨基酸残基为叶绿体转运肽,可能引导翻译后的肽链进入叶绿体.保守区块、特征基序分析及三维建模显示,序列中具有多个潜在的蛋白质修饰位点,以及PSY蛋白的保守区块和特征基序,包括两个保守的底物-镁离子结合位点和两个活性位点遮蔽残基,用于结合底物及保护催化反应中间产物;普通小球藻PSY蛋白中还具有一个特异的底物-镁离子结合位点,其活性和功能还未知.总之,研究结果揭示了普通小球藻psy基因的cDNA全长序列及可能的蛋白质序列结构特性,结果可为构建过表达载体,提高类胡萝卜素产量提供相关信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陶贤继	上海海洋大学水产与生命学院	16	41	3.0	5.0
2	刘冬雨	上海海洋大学水产与生命学院	2	4	2.0	2.0
3	魏华		24	45	4.0	5.0