利用滑动窗口和 KNN 算法识别差异甲基化区域

• 作者: 李华兵 杨昆
• 来源期刊: 杭州电子科技大学学报（自然科学版）
• 关键词: 差异甲基化区域 滑动窗口 KNN 分类器 多类问题 聚类指数
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 页码范围: 35-39
• 页数: 5页
• 分类号: TP391.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.13954/j.cnki.hdu.2016.04.008

摘要

针对现有差异甲基化区域 DMRs 识别方法中过度删除显著性弱的甲基化位点、DMRs 长度受限以及不能直接处理多类的问题，提出了一种利用滑动窗口和 KNN 算法识别不同类别间DMRs 的算法.算法先通过滑动窗口结合 KNN 分类器筛选候选区域，再根据误差率合并候选区域得到 DMRs.真实数据上的实验表明，算法的分类性能、聚类指数明显优于对照算法，扩展了对照的 Ong 算法识别的 DMRs 长度，并能发现 Ong 算法未发现的 DMRs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨昆	杭州电子科技大学计算学院	8	10	2.0	2.0
2	李华兵	杭州电子科技大学计算学院	1	2	1.0	1.0