基于多视角特征组合与随机森林的G蛋白 偶联受体与药物相互作用预测

• 作者: 刘光徽 於东军 胡俊
• 来源期刊: 南京理工大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 偶联受体 G蛋白偶联受体 药物 多视角特征 氨基酸组分 序列特征 分子指纹 随机森林
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 页码范围: 1-9
• 页数: 9页
• 分类号: TP391.4
• 字数: 8476字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14177/j.cnki.32-1397n.2016.40.01.001

摘要

为了提高G蛋白偶联受体( G-protein-coupled receptors,GPCR)与药物相互作用预测的精度,该文提出一种基于多视角特征组合与随机森林的GPCR-Drug相互作用预测新方法. 该方法首先从氨基酸组成成分和蛋白质进化视角分别抽取GPCR的序列特征,并从分子指纹视角抽取药物分子的特征;将所抽取的多视角特征进行组合,得到GPCR-Drug配对的特征表示;基于所提出的GPCR-Drug特征表示方法,使用随机森林构建预测模型. 在标准数据集上的交叉验证和独立测试结果验证了该文所述方法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	於东军	南京理工大学计算机科学与工程学院	64	503	15.0	19.0
2	刘光徽	南京理工大学计算机科学与工程学院	12	55	5.0	7.0
6	胡俊	南京理工大学计算机科学与工程学院	6	22	3.0	4.0