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摘要:
为了提高G蛋白偶联受体( G-protein-coupled receptors,GPCR)与药物相互作用预测的精度,该文提出一种基于多视角特征组合与随机森林的GPCR-Drug相互作用预测新方法. 该方法首先从氨基酸组成成分和蛋白质进化视角分别抽取GPCR的序列特征,并从分子指纹视角抽取药物分子的特征;将所抽取的多视角特征进行组合,得到GPCR-Drug配对的特征表示;基于所提出的GPCR-Drug特征表示方法,使用随机森林构建预测模型. 在标准数据集上的交叉验证和独立测试结果验证了该文所述方法的有效性.
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文献信息
篇名 基于多视角特征组合与随机森林的G蛋白 偶联受体与药物相互作用预测
来源期刊 南京理工大学学报(自然科学版) 学科 工学
关键词 偶联受体 G蛋白偶联受体 药物 多视角特征 氨基酸组分 序列特征 分子指纹 随机森林
年,卷(期) 2016,(1) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 1-9
页数 9页 分类号 TP391.4
字数 8476字 语种 中文
DOI 10.14177/j.cnki.32-1397n.2016.40.01.001
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 於东军 南京理工大学计算机科学与工程学院 64 503 15.0 19.0
2 刘光徽 南京理工大学计算机科学与工程学院 12 55 5.0 7.0
6 胡俊 南京理工大学计算机科学与工程学院 6 22 3.0 4.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
偶联受体
G蛋白偶联受体
药物
多视角特征
氨基酸组分
序列特征
分子指纹
随机森林
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南京理工大学学报(自然科学版)
双月刊
1005-9830
32-1397/N
南京孝陵卫200号
chi
出版文献量(篇)
3510
总下载数(次)
7
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
江苏省自然科学基金
英文译名:Natural Science Foundation of Jiangsu Province
官方网址:http://www.jsnsf.gov.cn/News.aspx?a=37
项目类型:
学科类型:
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