基于结构域理化性质的蛋白质相互作用方向预测

• 作者: 卫博翔 焦雄
• 来源期刊: 太原理工大学学报
• 关键词: 蛋白质 相互作用 结构域 理化特性 支持向量机 方向预测
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 应用力学
• 页码范围: 536-540
• 页数: 5页
• 分类号: Q518.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.16355/j.cnki.issn1007-9432tyut.2019.04.020

摘要

为了更好地理解蛋白质相互作用,用蛋白质相互作用间信号传递方向进一步注释蛋白质相互作用网络,提出了一种基于结构域理化性质预测蛋白质相互作用方向的方法.首先提取蛋白质结构域的10种理化性质,构成表示方向信息的特征向量;然后建立支持向量机预测模型,并利用网格搜索对模型进行参数寻优;最后用拥有最优参数的模型进行预测.实验结果表明,该模型准确率达到88.17％,AUC值为0.837.与PIDS方法比较结果表明,蛋白质结构域的10种理化性质能够有效用于蛋白质相互作用方向的预测,为预测蛋白质相互作用方向提供了一种新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	焦雄	太原理工大学生物医学工程学院	7	10	2.0	2.0
2	卫博翔	太原理工大学生物医学工程学院	1	1	1.0	1.0