小麦淀粉合成相关酶基因SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb表达序列多态性及对淀粉质量分数的影响

• 作者: 李卫华 李咏 王昊龙 蔡曼 韩俊杰
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 表达序列 核苷酸多态性 淀粉质量分数
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1150-1157
• 页数: 8页
• 分类号: S330
• 字数: 6795字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2016.08.006

摘要

为了探究小麦淀粉合成相关酶SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb基因表达序列核苷酸多态性及其与淀粉质量分数的关系,根据GenBank中已公布的基因序列设计特异引物,克隆基因的表达序列并测序,通过Clustal X2比对分析,用Dnasp 5.0计算核苷酸多态性信息,并建树做单倍型与淀粉质量分数的相关分析.结果表明,克隆得到3个基因的ORF(Open reading frame)序列,NCBI/Blast同源比对SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb与GenBank中已登记的序列的同源性分别为98.19％、98.64％和99.04％.在SSⅡa、SBEⅡa和SBEⅡb中分别发现40、14和18个SNP位点,其中共包括4个InDel.在,SSⅡa中,其第2外显子区为变异富集区,Tajima's D检验D值均不显著.可见,这3个基因的多态性信息均较丰富,其单核苷酸多态性与小麦淀粉质量分数之间存在一定的对应关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李卫华	石河子大学农学院	44	201	8.0	13.0
2	韩俊杰	石河子大学农学院	6	5	1.0	2.0
3	王昊龙	石河子大学农学院	1	5	1.0	1.0
4	李咏	石河子大学农学院	1	5	1.0	1.0
5	蔡曼	石河子大学农学院	1	5	1.0	1.0