2011-2013年柳州市部分HIV-1毒株gag基因测定及亚型分析

• 作者: 余钧池 冯献湘 刘鑫 陈柳军 黄萍 黎明强
• 来源期刊: 中华疾病控制杂志
• 学科: 医学
• 关键词: HIV-1 基因,gag 获得性免疫缺陷综合征
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 781-784
• 分类号: R512.91|R181
• 语种: 中文
• DOI: 10.16462/j.cnki.zhjbkz.2016.08.007

摘要

目的 了解2011-2013年柳州市人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布、流行毒株情况.方法 从2011-2013年柳州市HIV-1毒株样本中采用单纯随机抽样方法抽取120株作为研究对象,将120份样本从血浆中抽提核酸RNA,扩增HIV-1 gag基因片段,送至北京六合华大基因科技股份有限公司测序.合格序列利用数据库分析亚型以及利用MEGA5构建系统进化树.结果 得到合格的gag基因片段98条序列.来自gag基因片段的序列分析重组流行毒株(circulate recombinant forms,CRFs)的重组亚型CRF01 _AE占95.9％ (94/98),异性传播比例为79.8％ (75/94);重组亚型CRF07_BC占4.1％(4/98).样本1LZ022和1LZ032,1LZ025和3LZ029的bootstrap值分别为99.0％,100.0％,两两之间传播途径不同.结论 2011-2013年,柳州市HIV-1以重组亚型CRF01 _AE为主.柳州市重组亚型CRF01_AE从吸毒人群向异性接触感染人群蔓延.利用系统进化关系结合传播途径,便于分析传染源,为艾滋病干预措施提供有力佐证.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黎明强	柳州市疾病预防控制中心主任办公室	47	358	12.0	17.0
2	冯献湘	柳州市疾病预防控制中心性病与艾滋病防控科	25	91	5.0	8.0
3	余钧池	柳州市疾病预防控制中心微生物检验科	10	16	3.0	4.0
4	陈柳军	柳州市疾病预防控制中心微生物检验科	15	24	3.0	4.0
5	刘鑫	柳州市疾病预防控制中心微生物检验科	6	3	1.0	1.0
6	黄萍	柳州市疾病预防控制中心微生物检验科	7	13	3.0	3.0