基于16S rRNA和RubisCO基因对嗜酸硫杆菌的系统发育及多样性

• 作者: 倪永清 刘敏瑞 蔺朋武 齐兴娥
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: Acidithiobacillus spp. 16SrRNA基因 RubisCO基因 系统发育 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 664-679
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150304

摘要

[目的]明确不同地理来源的Acidithiobacillus spp.种群是否表现出显著的地域性和异域物种形成;为了解微生物谱系地理、多样性维持机制和微生物分子地理学提供基础数据.[方法]采用16SrRNA基因、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(RubisCO)功能基因序列同源性分析构建相应的系统发育树,分析Acidithiobacillus spp.种群的遗传多样性.[结果]从3个不同的地域分离到35株菌聚为5大类群,其中菌株YNTR4-15可能是铁氧化细菌(Leptspirillum ferrooxidans),菌株HBDY3-3被鉴定为另一铁氧化细菌(Leptospirillum ferrodiazotrophum);有4株可能是Acidithiobacillus ferrivorans;6株是Acidithiobacillus ferridurans,其余菌株均被鉴定为Acidithiobacilus ferrooxidan.对26株代表性菌株的RubisCO Ⅰ型cbbL基因和Ⅱ型cbbM基因的分析,发现19株菌具有双拷贝cbbL基因,分别为cbbL1和cbbL2基因;7株菌只检测到了cbbL1.cbbL1和cbbL2基因都有3个序列型;而cbbM基因是单拷贝.RubisCO基因的密码子偏爱性不强.[结论]分离自3个地域的菌株16SrRNA/RubisCO基因存在序列差异,Acidithiobacillus spp.种群存在显著的遗传多样性.嗜酸硫杆菌分离菌株基于16SrRNA基因的系统发育树和RubisCO基因的发育树不一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪永清	石河子大学食品学院	71	274	10.0	13.0
2	刘敏瑞	石河子大学食品学院	4	10	2.0	3.0
3	蔺朋武	石河子大学生命科学学院	3	5	1.0	2.0
4	齐兴娥	石河子大学食品学院	3	15	3.0	3.0