嗜热链球菌CRISPR-Cas系统的检测

• 作者: 唐雅茹 张丹青 李婉 李柏良 梁宏彰 王娜娜 霍贵成
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 嗜热链球菌 规律成簇的间隔回文重复(CRISPR) CRISPR-Cas系统 Cas 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 680-688
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20150314

摘要

[目的]CRISPR-Cas系统为嗜热链球菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,分析NCBI中已公开发表全基因组序列的9株嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型,对实验室相应菌株的CRISPR-Cas系统进行检测.[方法]利用生物信息学方法对NCBI中9株已测序嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统进行分析,根据其Cas基因序列设计引物,对实验室嗜热链球菌菌株的Cas基因进行扩增、测序,分析实验室6株嗜热链球菌的CRISPR-Cas系统情况.[结果]9株标准菌株均含不同数目的CRISPR-Cas系统,其类型主要为Ⅱ-A型、Ⅲ-A型和Ⅰ-E型,各类型的标志Cas基因高度保守.6株供试菌中,S4仅含Cas9基因,其它5株均含有Cas9基因、Ca1O基因和Cas9*基因,79和KLDS3.0207还含有Cas3基因.[结论]可根据标准菌株高度保守的Cas基因设计引物,预测未知嗜热链球菌所含CRISPR-Cas系统的数目和类型.S4仅含1个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统,其它5株均含有2个Ⅱ-A型CRISPR-Cas系统和1个Ⅲ-A型CRISPR-Cas系统,此外,79和KLDS3.0207均含有1个Ⅰ-E型CRISPR-Cas系统.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李婉	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	12	74	3.0	8.0
2	王娜娜	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	17	64	4.0	7.0
3	张丹青	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	5	6	2.0	2.0
4	李柏良	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	20	31	4.0	4.0
5	唐雅茹	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	4	22	3.0	4.0
6	梁宏彰	东北农业大学乳品科学教育部重点实验室	4	15	3.0	3.0