基于CO I基因序列的东、黄海区野生与养殖大黄鱼遗传多样性分析

• 作者: 凌建忠 姜亚洲 张凤英 张辉 王景 程家骅 谌微 马凌波 魏鸿擎
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大黄鱼 CO I基因 遗传多样性 遗传分化 群体
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1255-1267
• 页数: 13页
• 分类号: S931
• 字数: 8326字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2016.16064

摘要

为研究野生与养殖大黄鱼(Larimichthys crocea)群体的遗传多样性,对大黄鱼8个野生群体及6个养殖群体共336个样本的线粒体CO I基因部分序列进行了扩增和测序分析。实验最终获得序列片段长621 bp,总变异位点38个,简约信息位点23个,单变异位点15个,其中野生群体包含38个变异位点,占总变异的100%,养殖群体包含8个变异位点,占总变异的21.05%。在所有样本中共检测出单倍型34个,单倍型多样性为0.587,核苷酸多样性为0.00194,野生及养殖群体单倍型多样性指数分别为0.714~0.952、0.000~0.581。大黄鱼养殖与野生两个组群间的遗传分化指数为0.04982,占总变异的4.98%,差异极显著(P<0.01),组群间群体间的变异占1.46%(P>0.05),群体内的变异占93.56%(P<0.01)。以上结果表明,大黄鱼的遗传变异主要来自于群体内,养殖群体的遗传多样性显著低于野生群体,两者的遗传多样性程度均处于较低水平,养殖群体间或野生群体间不存在显著的遗传分化,而养殖与野生两大组群间存在着显著的遗传分化。此外,通过对群体遗传结构及进化树的分析表明,东、黄海大黄鱼应属于同一地理种群,但两者间存在较低程度的遗传分化现象,黄海的大黄鱼群体遗传多样性高于东海群体。本研究可为大黄鱼种质资源的保护和恢复提供理论依据。