通过配体文库研究GIPC2 PDZ配体结合特点及其相互作用蛋白

• 作者: 范成艳 郑直 郭正光
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: GIPC2 PDZ结构域 蛋白质相互作用 PDZ配体库 酵母双杂交
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 186-190
• 页数: 5页
• 分类号: Q513
• 字数: 3011字
• 语种: 中文

摘要

目的 通过验证性筛选配体文库,获得GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,进而找到GIPC2的相互作用蛋白.方法 1)利用酵母双杂交的方法从已有的PDZ配体库中寻找与GIPC2的PDZ结构域配体结合特性;2)根据GIPC2的亚细胞定位和肿瘤相关功能再结合PDZ结构域结合序列的共同特征在蛋白质数据库中预测GIPC2的天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列依次与GIPC2 PDZ结构域或GIPC2全长进行验证反应,从而得到阳性蛋白.结果 1)GIPC2 PDZ结构域的配体结合特性是C末端最后4个氨基酸为-X-S/T-X-V/L/I,是Ⅰ类PDZ配体;2)综合GIPC2的生物学特征和GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,在蛋白质数据库中预测得到47个天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列克隆至酵母双杂交系统进行验证,最后得到10个确定的阳性蛋白.结论 获得10个GIPC2相互作用蛋白.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭正光	中国医学科学院基础医学研究所生物化学与分子生物学系	7	2	1.0	1.0
2	范成艳	中国医学科学院基础医学研究所生物化学与分子生物学系	1	0	0.0	0.0
3	郑直	中国医学科学院基础医学研究所生物化学与分子生物学系	11	11	2.0	3.0