通过筛选随机多肽文库研究Veli3 PDZ结构域配体结合特性

• 作者: 杨涛 田瑞 马素参 高友鹤
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质相互作用 PDZ结构域 酵母双杂交 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 14-18
• 页数: 5页
• 分类号: Q51|Q71
• 字数: 2494字
• 语种: 中文

摘要

目的 研究Veli3 PDZ结构域配体的结合特性.方法 用Veil3 PDZ为诱饵蛋白,用酵母双杂交方法 筛选随机多肽文库.结合生物信息学方法 在各种数据库中检索与Veli3 PDZ识别规律相符合的天然人类蛋白质.然后根据蛋白质的功能和细胞定位等性质选择14个潜在新配体用酵母双杂交验证相互作用.文献检索与Veil3 PDZ配体结合的其他PDZ蛋白.结果 Veil3 PDZ结构域配体C-末端保守的氨基酸序列通式可以表示为:[E/X][S/T]X[V/I/L]-COOH(X表示任意氨基酸).这是Class I PDZ结构域配体的特点.用酵母双杂交实验证实14个生物信息方法 预测的潜在配体中有6个配体与Veil3相互作用.另一个PDZ蛋白PSD-95与已报道的Veil3 PDZ配体和本研究新发现的潜在配体有多个相互作用.结论 新发现的6个Veli3PDZ潜在配体为进一步研究Veil3的生物学功能提供新的线索.另外Veli3与PSD-95可能易于同时竞争结合同一配体,其生物学意义还有待进一步研究.