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三种方法提取金黄色葡萄球菌DNA的比较
三种方法提取金黄色葡萄球菌DNA的比较
作者:
肖刚
葛婧
钟雪珊
陈佑明
陈清
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
金黄色葡萄球菌
DNA提取
核酸
摘要:
目的:对三种金黄色葡萄球菌DNA提取方法的效果进行比较,以期获得一种简便、经济的提取方法。方法采用改良SDS法、NP40法和细菌DNA试剂盒法分别提取同一浓度的金黄色葡萄球菌ATCC25923细菌DNA,利用NanoDrop 2000核酸检测仪测定核酸浓度和纯度,纯度用核酸在波长260 nm处的吸光值与在波长280 nm处的吸光值的比值A260/A280表示,用1%琼脂糖凝胶电泳检测DNA质量;提取不同浓度梯度的金黄色葡萄球菌 ATCC25923细菌DNA,PCR扩增16S rDNA片段检测并比较三种方法的灵敏度。结果三种方法提取金黄色葡萄球菌所得核酸浓度差异有统计学意义(χ2=6.25,P<0.05),NP40法提取浓度较高,改良SDS法较低。试剂盒法提取的DNA纯度较高, A260/A280值在1.8~2.0之间;NP40法提取纯度较差;DNA电泳结果表明SDS法和TIANGEN试剂盒法提取的DNA条带清晰,无拖带现象,NP40法未出现DNA主带,且有拖带现象。所有方法所得DNA经PCR扩增均出现阳性条带。NP40法提取DNA的PCR检测敏感度最高,为1.5×106 cfu/ml,改良SDS法敏感度最低,为1.5×108 cfu/ml。结论 NP40法提取DNA成本低,耗时少,灵敏度高,适用于金黄色葡萄球菌的快速初筛。
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三种方法提取金黄色葡萄球菌DNA的比较
来源期刊
热带医学杂志
学科
医学
关键词
金黄色葡萄球菌
DNA提取
核酸
年,卷(期)
2016,(10)
所属期刊栏目
【实验研究论著】
研究方向
页码范围
1235-1238,1244
页数
5页
分类号
R378.11
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陈清
南方医科大学公共卫生学院
238
2007
21.0
32.0
2
陈佑明
南方医科大学第三附属医院检验科
31
193
9.0
11.0
3
葛婧
南方医科大学公共卫生学院
4
11
2.0
3.0
4
肖刚
南方医科大学第三附属医院检验科
16
120
6.0
10.0
5
钟雪珊
南方医科大学公共卫生学院
3
19
3.0
3.0
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引证文献(1)
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节点文献
金黄色葡萄球菌
DNA提取
核酸
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
热带医学杂志
主办单位:
广东省寄生虫学会
中华预防医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-3619
CN:
44-1503/R
开本:
大16开
出版地:
广州市中山二路74号中山医学院
邮发代号:
创刊时间:
1979
语种:
chi
出版文献量(篇)
7964
总下载数(次)
21
总被引数(次)
32495
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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