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基于迁移学习的蛋白质交互关系抽取
基于迁移学习的蛋白质交互关系抽取
作者:
周惠巍
李丽双
郭瑞
黄德根
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
蛋白质交互关系抽取
迁移学习
负迁移
摘要:
作为生物医学信息抽取领域的重要分支,蛋白质交互关系(Protein-Protein Interaction,PPI)抽取具有重要的研究意义.目前的研究大多采用统计机器学习方法,需要大规模标注语料进行训练.训练语料过少,会降低关系抽取系统的性能,而人工标注语料需要耗费巨大的成本.该文采用迁移学习的方法,用大量已标注的源领域(其它领域)语料来辅助少量标注的目标领域语料(本领域)进行蛋白质交互关系抽取.但是,不同领域的数据分布存在差异,容易导致负迁移,该文借助实例的相对分布来调整权重,避免了负迁移的发生.在公共语料库AIMed上实验,两种迁移学习方法获得了明显优于基准算法的性能;同样方法在语料库IEPA上实验时,TrAdaboost算法发生了负迁移,而改进的DisTrAdaboost算法仍保持良好迁移效果.
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文献信息
篇名
基于迁移学习的蛋白质交互关系抽取
来源期刊
中文信息学报
学科
工学
关键词
蛋白质交互关系抽取
迁移学习
负迁移
年,卷(期)
2016,(2)
所属期刊栏目
信息抽取与文本挖掘
研究方向
页码范围
160-167
页数
8页
分类号
TP391
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
周惠巍
18
88
5.0
9.0
2
黄德根
70
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19.0
33.0
3
李丽双
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郭瑞
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研究主题发展历程
节点文献
蛋白质交互关系抽取
迁移学习
负迁移
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中文信息学报
主办单位:
中国中文信息学会
中国科学院软件研究所
出版周期:
月刊
ISSN:
1003-0077
CN:
11-2325/N
开本:
16开
出版地:
北京海淀区中关村南四街4号
邮发代号:
创刊时间:
1986
语种:
chi
出版文献量(篇)
2723
总下载数(次)
5
总被引数(次)
45413
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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