高山被孢霉的基因组及转录组的提取技术研究

• 作者: 凌瑞 吴金勇 姚建铭 孙立洁 袁丽霞 陈祥松
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 高山被孢霉 基因组 转录组 提取技术
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 34-39
• 页数: 6页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2016.07.005

摘要

基因组和转录组的高通量测序对样品的纯度和含量要求较高，旨在通过研究高山被孢霉在不同培养条件下和采用不同菌丝处理方法对其基因组和转录组质量的影响来确定最佳提取方式。结果表明，PDA 培养基培养的菌丝与发酵培养基培养的菌丝经基因组提取后在琼脂糖凝胶电泳中有明显不同的表现，使用发酵培养基培养的菌丝提取的基因组 DNA 无降解，而以 PDA培养基培养的菌丝提取的基因组 DNA 出现部分降解。在使用国产试剂盒做高山被孢霉转录组 RNA 提取实验中发现，使用液氮速冻后破碎菌丝并结合使用β-疏基乙醇更易提取到高浓度且无降解的转录组样品。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈祥松	中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所	9	16	2.0	4.0
2	吴金勇	中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所	9	21	3.0	4.0
3	袁丽霞	中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所	9	22	3.0	4.0
4	孙立洁	中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所	7	8	2.0	2.0
8	凌瑞	中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所	1	0	0.0	0.0