三江黄牛mtDNA D-Loop区遗传多样性及系统进化

• 作者: 何世明 冉强 吴锦波 李键 柴志欣 汪琦 蹇尚林 钟金城 陈智华
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 三江黄牛 D-loop区 牛亚科 系统发育
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 页码范围: 1269-1278
• 页数: 10页
• 分类号: S823.8+1
• 字数: 7514字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1004-1389.2016.09.001

摘要

根据普通牛线粒体DNA序列设计引物,扩增获得三江黄牛线粒体D-loop区全序列,并以绵羊为外属对牛亚科代表性品种(类群)(九龙牦牛、野牦牛、瘤牛、欧洲野牛、中国水牛、亚洲水牛、德国普通牛、秦川牛、南阳牛、晋南牛、蒙古牛、平武牛、川南牛、凉山牛、湘西牛和昭通牛)的mtDNA D-loop序列进行系统进化分析,以期了解三江黄牛的遗传多样性,分析三江黄牛数量急剧下降的原因并提出参考意见.结果表明,三江黄牛线粒体D-loop区序列长909～911 bp,T、C、A、G碱基的平均含量分别为29.08％、24.49％、32.72％和13.71％;三江黄牛共有16种单倍型,平均单倍型多样性(Hd)为0.875 7,平均核苷酸多样性(Pi)为0.022 92,遗传多样性较为丰富;三江黄牛与已知牛品种(类群)mtDNA D-loop序列比对结果表明,与凉山牛差异最小(0.11％),与欧洲野牛差异最大(32.63％);系统进化分析显示三江黄牛是中国众多黄牛类群中的一支,与秦川牛、平武牛亲缘关系较近,推测其是由普通牛和瘤牛共同进化而来.