五个地方绵羊种群mtDNA D-loop区系统进化及遗传多样性分析

• 作者: 刘军峰 孙少华 孙洪新 敦伟涛 梁瑞圆 沈志强 王珏 陈晓勇
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 地方绵羊 线粒体基因组 起源 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（1）
• 页码范围: 135-142
• 页数: 8页
• 分类号: S826.03
• 字数: 4886字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2018.01.021

摘要

为探讨我国部分地方种群绵羊的起源进化及遗传多样性.对河北小尾寒羊、山东小尾寒羊、苏尼特羊、洼地绵羊、湖羊等5个地方绵羊种群mtDNA D-loop区全序列进行了测序和遗传变异分析,并利用生物信息学方法分析了种群间的亲缘关系以及母系起源.结果表明,5个绵羊种群mtDNA D-loop区序列共发现了135个多态位点,形成了108种单倍型.单倍型多样度为0.9740~0.9980;核苷酸多样度为0.01720~0.02222;全群平均核苷酸差异数K为20.795.NJ系统发育树表明,河北小尾寒羊与洼地绵羊先聚在一起,再与湖羊聚在一起,最后与苏尼特羊和山东小尾寒羊聚在一起.在所有的系统发育树及单倍型网络结构图中,均表明108种单倍型聚为3个单倍型群,单倍型群A包括70只绵羊个体,单倍型群B包括48只绵羊,单倍型群C包括13只绵羊.河北小尾寒羊与洼地绵羊遗传距离最近,其次为湖羊、苏尼特羊、山东小尾寒羊.该种群遗传多样性丰富,与山东小尾寒羊、苏尼特羊、湖羊、洼地绵羊等种群存在基因交流.