大别山牛mtDNA D-loop区遗传多样性和系统进化分析

• 作者: 刘善斋 刘洪瑜 张运海 石高丽 程敏
• 来源期刊: 安徽农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大别山牛 mtDNA D-loop 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2018,（5）
• 所属期刊栏目: 动物科学与动物医学
• 页码范围: 842-847
• 页数: 6页
• 分类号: S823
• 语种: 中文
• DOI: 10.13610/j.cnki.1672-352x.20181023.026

摘要

通过PCR扩增技术对46头大别山母牛mtDNA D-loop区进行测序并得到其全序列,再从GenBank上下载中外部分黄牛品种mtDNA D-loop区的全序列,运用生物学软件对大别山牛的遗传进化进行分析.结果发现,46头大别山牛mtDNA D-loop序列长度在955～1 101 bp之间,有176个变异位点,约占核苷酸总数的16.18％,其中单一信息位点120个,简约信息位点56个.共有25种单倍型,单倍型多样性(Hd)为0.877,核苷酸多样性(Pi)为0.023 96,平均核苷酸差异数(k)为21.544,A、T、C和G4种碱基含量所占比例分别为32.72％、28.46％、25.19％和13.63％,表明大别山牛有较为丰富的遗传多样性.遗传距离分析结果表明,大别山牛与吉安牛、雷州牛、鲁西牛、闽南牛、皖南牛和湘西牛的遗传距离最小,与欧洲野牛亲缘关系最远,由系统发育树可推测大别山牛属南方牛种,属普通牛和瘤牛的混合母系起源.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张运海	安徽农业大学动物科技学院	61	264	9.0	14.0
3	刘洪瑜	安徽农业大学动物科技学院	21	65	5.0	6.0
7	程敏		2	0	0.0	0.0
10	石高丽	安徽农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0