河南地方猪mtDNA D-loop序列遗传多样性 及系统进化分析

• 作者: 乔瑞敏 刘贤 李新建 李秀领 段栋栋 王克君 王明宇 薛亚辉 韩雪蕾
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 河南地方猪 mtDNA D-loop区 遗传多样性 系统进化
• 年，卷（期）: 2020,（3）
• 所属期刊栏目: 畜牧与兽医科学
• 页码范围: 452-461
• 页数: 10页
• 分类号: S828
• 字数: 4374字
• 语种: 中文

摘要

为了解河南省地方猪种的遗传资源状况,探究猪种间的亲缘关系,对河南省地方猪种(南阳黑猪、确山黑猪、淮南猪、豫西黑猪)及2个参考猪种(莱芜黑猪、二花脸猪)和野猪共计282个样本的mtDNA D-loop序列进行PCR扩增及序列测定,并结合GenBank中3个国外猪种(杜洛克猪、长白猪、约克夏猪)的38条mtDNA D-loop序列,进行单倍型、遗传多样性、系统发育树、网络分析、歧点分布分析.结果表明,河南省地方猪4个品种共236条序列,定义了32种单倍型,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.788～0.854、0.00156～0.00455.构建的NJ系统进化树将所有样本分为2个独立分支,一支包含所有河南各猪种和部分约克夏猪,另一支全部为引进猪种,表明河南地方猪和3个国外猪种具有2个明显不同的母系起源.网络中介图和歧点分布显示,在历史驯养过程中,整个河南地方猪群体曾经历过群体扩张事件.说明河南地方猪种具有较为丰富的遗传多样性,且彼此之间有一定的基因交流.