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蜻蜓凤梨AfERF113基因的克隆与表达特性
蜻蜓凤梨AfERF113基因的克隆与表达特性
作者:
乔飞
徐立
李志英
王加宾
雷明
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
蜻蜓凤梨
AP2/EREBP家族
AfERF113
乙烯
表达分析
摘要:
观赏凤梨是一类重要的热带花卉,但有关其生长发育调控分子机理的研究相对匮乏,这在一定程度上限制了新品种的开发和利用.以热带观赏花卉蜻蜒凤梨(Aechemia asciata)为材料,在分析蜻蜓凤梨转录组数据的基础上,结合eDNA末端快速扩增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术克隆了APETA-LA2/Ethylene Response Element Binding Protein(AP2/EREBP)家族的1个转录因子编码序列,并将其命名为AfERF113.生物信息学分析表明,AfERF113 cDNA全长1 (093 bp,有1个864 bp的开放阅读框(openreading frame,ORF),编码287个氨基酸.蛋白质理化性质分析表明,该蛋白分子质量为29.768 5 ku,理论等电点为6.06,为一类不稳定的酸性亲水蛋白.亚细胞定位软件预测表明该蛋白定位于细胞核.结构域分析表明,该蛋白有1个保守的AP2结构域,分属ERF亚族的B-4类,与拟南芥中所有ERF蛋白的ERF113亲源关系最近.实时荧光定量PCR(quantitative real time PCR,qRT-PCR)结果表明,AfERF113转录本在成熟株的根中表达量最高,且外源乙烯诱导后,A fERF113的表达量无论是在幼株还是在成株的各组织中均显著上调.研究结果证实,AfERF113响应了外源乙烯调控,为进一步研究AfERF113基因的功能及通过基因工程手段调控凤梨科植物生长发育提供了理论依据.
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文献信息
篇名
蜻蜓凤梨AfERF113基因的克隆与表达特性
来源期刊
西北农业学报
学科
农学
关键词
蜻蜓凤梨
AP2/EREBP家族
AfERF113
乙烯
表达分析
年,卷(期)
2016,(12)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1851-1860
页数
10页
分类号
S682.39
字数
6744字
语种
中文
DOI
10.7606/j.issn.1004-1389.2016.12.016
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
徐立
56
470
12.0
20.0
2
李志英
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创新重点实验室
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乔飞
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创新重点实验室
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雷明
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创新重点实验室
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王加宾
中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创新重点实验室
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引证文献(0)
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蜻蜓凤梨
AP2/EREBP家族
AfERF113
乙烯
表达分析
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期刊影响力
西北农业学报
主办单位:
西北农林科技大学
甘肃
宁夏
青海
新疆农(林)业科学院及青海
新疆畜牧(兽医)科学院及新疆农垦科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-1389
CN:
61-1220/S
开本:
大16开
出版地:
陕西杨陵邰城路3号大铁10号信箱
邮发代号:
52-111
创刊时间:
1992
语种:
chi
出版文献量(篇)
6569
总下载数(次)
7
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