Docker技术在生物信息学中的应用

• 作者: 佟凡 屈武斌 李江域 王小磊 赵东升
• 来源期刊: 军事医学
• 学科: 生物学
• 关键词: Docker 云计算 生物信息学 标准化 复用性
• 年，卷（期）: 2016,（7）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 614-617
• 页数: 4页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 3802字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7644/j.issn.1674-9960.2016.07.019

摘要

随着高通量测序、蛋白质组学等生物技术的迅猛发展，生物医学数据、生物信息学工具及分析应用需求均呈现出多样性和复杂性的特点。传统的生物信息计算环境如专用工作站、虚拟机等已无法较好地适应这一情况。Docker作为一种新兴的容器技术，具有轻量、开放和安全的优点，为分析和处理生物大数据提供了一种新的解决方案，得到生物信息学开发和应用人员越来越多的关注与使用。该文针对大数据时代下生物信息学工具开发、部署、应用的要求和特点，分析Docker技术在生物信息学中应用的优势，介绍了该技术在生物信息学中的具体应用案例，探讨其有待改进的方面以及未来发展趋势。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵东升	军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所	72	313	9.0	13.0
2	王小磊	军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所	15	29	3.0	4.0
3	李江域	军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所	11	29	4.0	4.0
4	佟凡	军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所	1	7	1.0	1.0
5	屈武斌		1	7	1.0	1.0