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甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析
甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析
作者:
李杨瑞
梁潘霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
甘蔗
细胞色素b6-f复合体铁硫亚基
克隆
生物信息学分析
表达
摘要:
以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的cDNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为796 bp,包括1个579 bp的开放阅读框,编码192个氨基酸.甘蔗与高粱CYT基因cDNA序列的同源性为94.0%,氨基酸序列同源性为99.0%;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50 ~2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19%,随机卷曲占53.12%,延伸链占21.53%,β-转角只占8.33%,GenBank登录号为JQ712582.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,SoCYT基因表达均呈下降的趋势,PEG与PEG加Si处理的SoCYT基因的表达量有显著差异,加硅可减缓SoCY7基因表达的下降速度和对细胞色素b6/f复合体的结构的损伤和影响.
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内容分析
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文献信息
篇名
甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析
来源期刊
西南农业学报
学科
农学
关键词
甘蔗
细胞色素b6-f复合体铁硫亚基
克隆
生物信息学分析
表达
年,卷(期)
2016,(5)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源
研究方向
页码范围
1032-1037
页数
6页
分类号
S566.1
字数
4236字
语种
中文
DOI
10.16213/j.cnki.scjas.2016.05.008
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
梁潘霞
广西农业科学院资源与环境研究所
21
150
7.0
11.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
甘蔗
细胞色素b6-f复合体铁硫亚基
克隆
生物信息学分析
表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西南农业学报
主办单位:
四川
云南
贵州
广西
西藏及重庆省(区
市)农科院
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-4829
CN:
51-1213/S
开本:
大16开
出版地:
成都市外东沙河大桥侧
邮发代号:
62-152
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
8472
总下载数(次)
8
总被引数(次)
71178
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