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摘要:
目的:检测大鼠心肌细胞缺氧后微小 RNA(miRNA,miR)-133a-3p 的表达,并预测其潜在靶基因和进行初步验证。方法分离培养 SD 大鼠乳鼠心肌细胞,给予缺氧(37℃,5%CO2,1%O2)0 h、4 h、8 h、12 h、16 h、20 h 和24 h,采用 qRT-PCR 检测其在上述不同时间点的 miRNA-133a-3p 的表达水平,运用 miRanda、picTar 和 tergetScan 等靶基因预测分析软件及其他生物信息学方法,筛选 miR-133a-3p 潜在调控的靶基因,并对关键候选基因采用 qRT-PCR 和 Western blot 进行初步验证。结果大鼠心肌细胞中miRNA-133a-3p 的表达在缺氧4 h 出现高表达,与其他缺氧时间比较差异有统计学意义(P =0.000);4 h 后,其表达逐渐下降,12 h后趋于稳定;生物信息学预测发现 miRNA-133a-3p 的靶基因可能为 TGF-β1;荧光定量检测发现在4 h 时 TGF-β1的表达较0 h、24 h的差异都有统计学意义(P <0.05);且4 h 时心肌细胞 TGF-β1蛋白的表达较0 h 组和24 h 组都明显升高,差异具有统计学意义(P <0.05)。结论 miRNA-133a-3p 可能参与大鼠心肌细胞的缺氧坏死过程,并且可能通过调控 TGF-β1而发挥作用。
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文献信息
篇名 大鼠心肌细胞缺氧后 miR-133a-3p 的表达及其下游靶基因预测
来源期刊 局解手术学杂志 学科 医学
关键词 miRNA-133a-3p 心肌细胞 缺氧 TGF-β1 生物信息学
年,卷(期) 2016,(11) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 784-788
页数 5页 分类号 R541.4
字数 3920字 语种 中文
DOI 10.11659/jjssx.05E016060
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 陈文江 广东医学院研究生学院 14 59 5.0 6.0
2 王玲 恩施土家族苗族自治州中心医院心内科 10 28 3.0 5.0
3 刘长召 恩施土家族苗族自治州中心医院心内科 7 23 3.0 4.0
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研究主题发展历程
节点文献
miRNA-133a-3p
心肌细胞
缺氧
TGF-β1
生物信息学
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
局解手术学杂志
月刊
1672-5042
50-1162/R
大16开
重庆市沙坪坝区高滩岩正街30号
BM1815
1992
chi
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3
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