三个小麦防御素基因的克隆及序列分析

• 作者: 丁汉凤 史灵敏 张斌 彭振英 李娜娜 高文伟
• 来源期刊: 山东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 小麦 植物防御素 基因克隆 序列分析 组织特异性表达
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术?遗传育种?种质资源
• 页码范围: 1-8
• 页数: 8页
• 分类号: S512.101
• 字数: 5355字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14083/j.issn.1001-4942.2016.11.001

摘要

本试验从济麦22幼叶中克隆得到三个小麦防御素基因 TaPDF（Triticum aestivum defensin），分别命名为 TaPDF32、TaPDF33和 TaPDF34（GenBank 登录号分别为 BT009185、BT009167和 BT009022）。序列分析发现，三个防御素基因各自含有一个长度为243、249 bp 和225 bp 的开放阅读框（open reading frame， ORF），依次编码长度为80、82个和74个氨基酸的蛋白。成熟蛋白的分子量均约为5．5 kD，等电点均大于7，含有8个保守的 Cys 残基。保守结构域分析发现，TaPDF32含有一个γ－硫堇功能结构域，TaPDF33和 TaP-DF34均含有一个 Knot1功能结构域，两者均是植物防御素的典型结构域，因此这三个 TaPDF 属于典型的植物防御素蛋白。SWISS －MODEL 在线软件分析表明，三个 TaPDF 的三级结构均由三股反平行的β－折叠和一个α－螺旋组成。系统进化分析表明，TaPDF32、TaPDF33的氨基酸序列与玉米、粟米的防御素相似性较高，而TaPDF34与大豆的防御素相似性较高，但均与已经报道的小麦防御素相似性较低，表明 TaPDF32、TaPDF33和TaPDF34是小麦三个新的防御素蛋白。荧光定量 RT －PCR 分析发现，TaPDF32、TaPDF33基因在小麦叶片中表达量最高，种子次之，根中最低；TaPDF34基因在叶、种子和根中的表达量基本相同。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高文伟	新疆农业大学农学院	68	421	12.0	18.0
2	李娜娜		24	144	6.0	11.0
3	丁汉凤		34	250	9.0	15.0
4	彭振英	新疆农业大学农学院	1	1	1.0	1.0