精氨酸侧链和核酸碱基间离子氢键作用强度分析

• 作者: 姜笑楠 李蕾 王长生 高希婵 黄翠英
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 精氨酸侧链 核酸碱基 离子氢键 结合能 质子化反应焓变
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 分析化学(Analytical Chemistry)
• 页码范围: 1460-1467
• 页数: 8页
• 分类号: O641
• 字数: 5715字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20160346

摘要

采用MP2/6-31+G( d,p)方法优化得到了22个由精氨酸侧链与碱基尿嘧啶、胸腺嘧啶、胞嘧啶、鸟嘌呤及腺嘌呤形成的氢键复合物的气相稳定结构,使用包含BSSE校正的MP2/aug-cc-pVTZ方法计算得到了复合物的气相结合能,通过 MP2/6-31+G(d,p)方法和 PCM 模型优化得到了复合物的水相稳定结构,采用MP2/aug-cc-pVTZ方法和PCM模型计算得到了复合物的水相结合能。研究发现,精氨酸侧链与碱基间的离子氢键作用强度与单体间电荷转移量、氢键临界点电子密度及二阶作用稳定化能密切相关。与中性氢键相比,离子氢键作用具有更显著的共价作用成分。研究还发现,精氨酸侧链和碱基间形成的氢键复合物的稳定性次序可以通过氢键受体碱基分子上氧原子和氮原子的质子化反应焓变进行预测,质子化反应焓变越负,形成的氢键复合物越稳定。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王长生	辽宁师范大学化学化工学院	51	137	6.0	7.0
2	李蕾	辽宁师范大学化学化工学院	9	9	2.0	3.0
3	姜笑楠	辽宁师范大学化学化工学院	14	17	2.0	4.0
4	高希婵	辽宁师范大学化学化工学院	2	3	1.0	1.0
5	黄翠英	辽宁师范大学化学化工学院	18	53	3.0	7.0