基于 OpenCL 的蛋白质转换算法

• 作者: 徐沛彦 施慧彬
• 来源期刊: 计算机与数字工程
• 学科: 工学
• 关键词: 蛋白质 转换算法 笛卡尔积 OpenCL
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 算法与分析
• 页码范围: 1420-1422,1435
• 页数: 4页
• 分类号: TP301.6
• 字数: 2331字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-9722.2016.08.006

摘要

为了提高蛋白质转换算法的加速比，提出了基于 OpenCL 的蛋白质转换算法。通过研究笛卡尔积算法中的并行性，论文首先在 CPU 中实现了串行蛋白质转换算法，再使用 OpenCL 技术在 GPU 中实现并行蛋白质转换算法。测试结果表明，使用 GPU 平均加速比为1．42x 。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施慧彬	南京航空航天大学计算机科学与技术学院	26	100	5.0	8.0
3	徐沛彦	南京航空航天大学计算机科学与技术学院	2	2	1.0	1.0