基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

• 作者: 倪学勤 周梦佳 徐帅 曾东 曾燕 林奕岑
• 来源期刊: 动物营养学报
• 学科: 农学
• 关键词: 肉鸡 回肠 高通量测序 核心菌群 PICRUSt
• 年，卷（期）: 2016,（8）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 2581-2588
• 页数: 8页
• 分类号: S811.6
• 字数: 4888字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2016.08.031

摘要

本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序，按照97％的相似度归类操作分类单元（ OTUs），去除序列数量少的OTUs（ n＜2），然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明：1）共获得424062条tags，并归类于1002个非单 OTUs，样品平均 tags 为（28271±8855）条，平均 OTUs 为（261±82）个。2）所有样品共含有20个菌门，160个菌属。其中，共享核心菌门4个，分别是厚壁菌门（85．35％）、变形菌门（6．09％）、蓝细菌门（2．15％）和放线菌门（0．16％）；共享核心菌属19个，占样品微生物总量的93．75％。3）鸡回肠样品预测得出328个功能。从前20个功能热图可知，各样品的效能存在差异。由此可见，鸡回肠微生物群落复杂，但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供了参考依据。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	倪学勤	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	103	967	18.0	27.0
2	曾东	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	55	321	11.0	16.0
3	徐帅	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	1	11	1.0	1.0
4	林奕岑	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	1	11	1.0	1.0
5	周梦佳	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	5	38	3.0	5.0
6	曾燕	四川农业大学动物医学院动物微生态研究中心	8	26	3.0	5.0