一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体IME-CF2的分离、测序及全基因组分析

• 作者: 刘小东 孙强 安小平 张湘莉兰 王伟 童贻刚 米志强 黄勇
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 弗氏柠檬酸杆菌 噬菌体 全基因组测序 基因组分析
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 315-319
• 页数: 5页
• 分类号: Q939.48
• 字数: 4444字
• 语种: 中文

摘要

目的 从医院污水中分离一株能裂解弗氏柠檬酸杆菌的噬菌体,观察其形态,并进行全基因组测序和全基因组分析,为治疗和控制弗氏柠檬酸杆菌感染提供基础.方法 以弗氏柠檬酸杆菌为宿主,从医院污水分离噬菌体,用透射电镜观察其形态;使用Ion Torrent测序平台进行噬菌体全基因组测序,测序后进行噬菌体全基因组序列组装、注释、进化分析和比较分析.结果 成功分离一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体,命名为IME-CF2;电镜观察显示,该噬菌体具有二十面体的头部,形态类似肌尾噬菌体科;IME-CF2核酸类型为DNA,基因组全长为177 685 bp,GC含量为43.2％;编码267个编码区(CDS),2个tRNA;进化分析表明,IME-CF2属于T4类噬菌体,全基因组比较分析表明,IME-CF2与柠檬酸杆菌噬菌体Miller同源性最高.结论 分离鉴定了一株弗氏柠檬酸杆菌噬菌体,进行了全基因组测序和分析,为噬菌体治疗多重耐药细菌奠定了基础.